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El dextran sulfato es un polisacárido similar a la heparina, que mejora la tasa de hibridación de los ácidos nucleicos entre 3 y 100 veces, dependiendo de la sonda utilizada (2-4). Esto se debe a una reducción del volumen de la muestra que contiene ADN por parte del polímero, que concentra el ADN (1, 4). El dextran sulfato solo debería aplicarse cuando la tasa de hibridación o la cantidad de ADN sea un factor limitante para la identificación de secuencias "raras". El mayor efecto con el dextran sulfato se observa con polinucleótidos de > 250 nucleótidos de longitud. No hay ninguna mejora con oligonucleótidos de menos de 14 bases de longitud. Además, no hay ninguna ventaja para la hibridación de colonias o placas bacterianas. Incluso puede dar lugar a un fondo elevado. La manipulación del dextran sulfato se ve dificultada por su alta viscosidad (4). Una solución madre al 50 % es ligeramente amarilla (2), la concentración de trabajo es del 10 %. Si las soluciones acuosas de dextran sulfato tienen que ser esterilizadas en autoclave, deben ser tamponadas, por ejemplo con bicarbonato de sodio, para evitar su descomposición durante la esterilización en autoclave.
Literature
(1) Wetmur, J.G. (1975) Biopolymers 14, 2517-2524. Aceleración de las tasas de renaturalización del ADN. (2) Wahl, G.M. et al. (1979) Proc. Acad. Sci. USA 76, 3683-3687. Transferencia eficiente de grandes fragmentos de ADN desde geles de agarosa a papel de diazobenziloximetilo e hibridación rápida mediante el uso de sulfato de dextrano. (3) Meinkoth, J. & Wahl, G. (1984) Anal. Biochem. 138, 267-284. Revisión: Hibridación de ácidos nucleicos inmovilizados. (4) Sambrook, J., Fritsch, E.F. & Maniatis, T. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 2ª edición, página 9.50. Cold Spring Harbor Laboratory Press. Cold Spring Harbor, Nueva York.
